L'economia del sistema UV è determinata dai seguenti fattori: costo e durata delle apparecchiature; efficienza elettrica; grado di riduzione dell'effetto di sterilizzazione durante il funzionamento; costi dell'elettricità, ecc. L'analisi economica del sistema di disinfezione ultravioletta non è ancora giunta a una conclusione. Ci sono molte relazioni di analisi con conclusioni diverse. Ci sono opinioni che il dispositivo di disinfezione ultravioletta consuma molta elettricità e la manutenzione e il costo dell'apparecchiatura sono elevati. Per i grandi sistemi, l'investimento delle attrezzature è superiore a quello del sistema di ozono e il costo operativo è simile a quello dell'ozono; ma per il piccolo sistema di produzione di acqua pura, l'investimento è inferiore a quello del dispositivo di ozono. Si opinione inoltre che per le bilance di trattamento di migliaia di tonnellate/giorno o più, i costi di investimento e di esercizio del sistema di disinfezione UV siano molto vantaggiosi, che sono molto inferiori al costo della clorazione e della disinfezione dell'ozono. Ad esempio, ci sono dati analitici che segnalano che quando si costruisce un piccolo impianto di trattamento dell'acqua potabile con una popolazione compresa tra 10 e 25.000, il rapporto approssimativo tra i costi di disinfezione di ultravioletti, biossido di cloro e ozono è di 1:4: (8-9), per una popolazione superiore a 500.000 organizzazioni sociali, il rapporto costi è di circa 1:2.5:2.5.
Queste stime dei costi non includono il costo aggiuntivo della rimozione dei prodotti disinfezione e delle cisti criptosporidiche quando si utilizzano processi di disinfezione non UV. Inoltre, i dati di analisi mostrano che i costi di investimento e di esercizio della disinfezione ultravioletta sono inferiori a quelli della disinfezione del cloro e il costo di disinfezione è circa la metà di quello del cloro, ma la differenza si riduce con l'espansione della scala di trattamento delle acque.
In Francia e nell'ex Unione Sovietica, la disinfezione ultravioletta era limitata a piccole attrezzature. La grande attrezzatura stabilita era quella di installare lampade ultraviolette in serie nella rete di acqua filtrata. Negli Stati Uniti, la disinfezione ultravioletta è anche limitata a piccole attrezzature e piscine ed è spesso combinata con altri disinfettanti. Tuttavia, è stato riferito in applicazioni pratiche che la scala delle piante di acqua potabile che utilizzano la disinfezione ultravioletta ha superato 1,5 milioni di tonnellate al giorno.